导读
年科学家在Science杂志上发表过VirScan可作为有效检测病毒感染的诊断方法。VirScan的原理是筛查血液中感染人类的病毒抗体，近日有研究者将mNGS与VirScan相结合，诊断神经系统EV-A71的感染。
来自加州大学旧金山分校的研究者在NeurolNeuroimmunolNeuroinflamm杂志上发表成果：在爆发EV-A71脑干炎的疑似患者中，采用qRT-PCR进行EV-A71的检测，之后通过mNGS在患者的脑脊液、血浆、粪便、鼻咽拭子中进行了病原鉴定，发现mNGS对于EV-A71的鉴定敏感度较qRT-PCR更高，同时采用VirScan检测病毒抗体并通过ELISA验证，证实mNGS和VirScan相结合显著提高了EV-A71的检出率，mNGS帮助发现了共感染，这些共感染与患者的临床表征与预后相关。
研究背景在加泰罗尼亚爆发的EV-A71神经系统感染患者中，感染人群大都是儿童。研究者通过对EV-A71的检测发现，在脑干炎患者的脑脊液样本中，pan-EVqRT-PCR检测均为阴性，考虑到病毒的变异，推测有可能限制了qRT-PCR对该病毒的检测能力。为了解决这一疑虑，研究者采用无偏向性的mNGS展开了病原的全面鉴定。研究概况结果（1）qRT-PCR检测EV阳性的25例样本中，mNGS也是阳性，一致率%；（2）qRT-PCR检测EV阴性的35例样本中，mNGS在8例中检出EV阳性；
（3）qRT-PCRvsmNGS的阳性率为：42%vs57%；
（4）mNGS检出阳性的标本中，有4例为EV-A71与E-30共感染；2例EV-A71与CVB共感染；
（5）VirScan检测经ELISA验证的EV病毒的阳性率：92%；
（6）针对各种样本类型，mNGS与VirScan结合，能够显著提高EV-A71的检出率；同时mNGS能够发现共感染类型；
结论mNGS与VirScan结合，能够显著提高中枢神经系统患者中EV-A71的检出率；mNGS能够发现共感染；mNGS对EV-A71基因组的组装让人们对其有了新的认识。讨论与分析EV-A71在脑脊液中的丰度很低，mNGS在qRT-PCR检测不到的标本中检测到了EV-A71，因为mNGS能够从病毒基因组的任何位置鉴定EV病毒，这一点提高了其相对于qRT-PCR的敏感性；mNGS发现了与EV病毒的共感染，提示我们在病毒爆发的过程中，mNGS能够无偏向性地发现共感染，而共感染影响着患者的临床症状与预后；通过mNGS，对EV-A71的基因组有了新的认识，宏基因组组装的神经毒性EV-A71的基因组与德国、非洲、中国等的神经毒性的EV-A71病毒株的基因组有关，而不同于曾经在西班牙发现的手足口病相关的EV-A71病毒序列。免疫系统在发现病毒首次入侵的时候，会产生病原体特异性抗体，而VirScan正是利用这一点来发现病毒。不仅能识别免疫系统正在应对的病毒感染，还可提供曾经的感染信息。小编有感mNGS基于对核酸序列的检测来无偏向性的发现病毒序列，而VirScan基于抗原抗体的特异性反应来发现病毒。小编认为两者的结合，从核酸水平和蛋白水平检测病毒，相辅相成，互相补充，互相验证，发挥了1+1＞2的效果。同时由于mNGS检测的全面性，能够发现其他的潜在感染，更好地解释不同患者的临床症状与预后。往期推荐「文献透视镜」丨mNGS助力SARS-CoV-2与其他病原体共感染诊断，降低患者死亡率
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