回头看看，关于DNA损伤修复的文章分享了好几篇，索性又扒了扒老文章，找到了一篇17年的nature子刊，看的是DNA损伤修复过程中的γH2AX，具体内容如下：
作者想研究DNA损伤修复过程中γH2AX，先用共聚焦和WB看了一下伴随修复过程γH2AX的变化趋势
看看损伤后不同时间点细胞周期、增殖情况
作者除了想用SIM超分辨观察外，还想用ChIP-seq，又验证了一下抗体和测序
准备工作做好之后，作者构建自己的方法：把SIM超分辨、ChIP-seq、数据库挖掘整合到一起，在纳米水平找到参与DNA损伤修复的结构单元
先用共聚焦和SIM（SIM原始数据可以转出宽场图片，对应pseudo-widefield；转出的宽场图片又可进行反卷积，对应+deconvolution）分别观察DNA损伤后不同时间细胞核内γH2AX蛋白点的数目，四种图片模式都反映出随修复进行γH2AX蛋白点先增多后减少的趋势，值得注意的是SIM宽场、SIM宽场反卷积、SIM计出的点数均比共聚焦多（光漂白、分辨率的限制造成了共聚焦计数偏低）
再看完随修复进行γH2AX点数的变化之后，又用SIM看了一下γH2AX蛋白点的尺寸
又拿分辨率更高的STED技术看了一下蛋白点的尺寸，发现STED测得的尺寸只比SIM测得的小了20%左右，验证了SIM超分辨的数据
再染γH2AX的同时，作者用DAPI还染了DNA，对γH2AX处DNA含量进行了测量，发现随修复进行，γH2AX处DNA含量先升高后降低
别忘了作者还计划了ChIP-seq，测序的数据观察到的DNA含量变化趋势和超分辨一致
ChIP-seq数据如果只看一个γH2AX包裹的DNA含量就亏了，作者将不同时间点的ChIP-seq数据和数据库放到一起，看损伤后不同时间点γH2AX在基因组上的分布情况，发现修复早期γH2AX主要分布在常染色质（以H3K36me3为marker），修复末期则分布到了异染色质（以H3K9me3为marker），暗示先修复常染色质再修复异染色质
ChIP-seq看到的γH2AX分布在SIM超分辨上验证一下，发现γH2AX的确是早期在常染色质上，末期在异染色质上
常染色质异染色质的DNA压缩程度不同，γH2AX随修复进行在常染色质、异染色质上分布的变化又让作者
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