导语
新冠与其他呼吸道病毒感染，譬如流感病毒感染症状颇为相似，临床也存在共感染案例，正确识别病原体是公卫防疫首要内容。近日华盛顿大学和波士顿大学的研究者采用宏基因组二代测序（mNGS）在疑似COVID-19的患者中成功检测到SARS-CoV-2，并经过qRT-PCR的验证，同时发现患者除了有SARS-CoV-2感染之外，还同时共感染了人类副流感病毒3型、卡他莫拉菌等。对于迅速出现的传染性疾病，mNGS能够从流行病学的角度恢复整个病毒基因组序列，同时为发现与发病率和死亡率增加有关的共感染情况提供了机会。
研究背景自从新冠病毒疫情爆发以来，疫情迅速蔓延。新冠感染的流行病学分析显示65岁以上的老年患者死亡率风险很高，特别是潜在的合并感染会导致死亡率增加。
研究概况研究结果（1）在qRT-PCR检测SARS-CoV-2的8例患者中，6例阳性，2例阴性；阳性率75%；
（2）mNGS对8例患者进行检测，6例SARS-CoV-2的阳性患者中，3例SARS-CoV-2单独感染；1例SARS-CoV-2与HPIV3共感染；2例除了SARS-CoV-2之外，还发现了M.catarrhalis；（3）mNGS在2例SARS-CoV-2阴性的患者中，发现了HRV-A和HRV-C。研究结论宏基因组mNGS分析在监测传染性疾病发展、应对本次新冠疫情及未来病毒性传染性疾病当中具有很高的应用价值。讨论分析本研究采用mNGS技术，成功从6个样本中检测到了SARS-CoV-2，并全部通过qRT-PCR验证；并且之前研究者已经采用宏基因组分析得到了SARS-CoV-2的全部基因组序列，这表明在未来，一旦出现类似的未知传染性疾病，mNGS有很大的价值。本研究表明传统方法针对SARS-CoV-2的检测并不能排除SARS-CoV-2的共感染情况，而mNGS能够无偏向性地发现这一点；专家认为在未来，mNGS能够极大地提高共感染情况的检测效率，辅助精准诊断与病情管理，挽救更多的生命。
小编有感mNGS检测通量高，在感染性疾病病原体检测领域已经得到了广泛的应用，在此次新冠疫情当中，mNGS也发挥了很关键的作用，在未来病毒性传染性疾病当中具有很高的应用前景。随着技术不断优化，相信mNGS有望成为临床常规的病原学检测方法之一。
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